激光共聚焦掃描顯微鏡主要有四部分組成：1、顯微鏡光學(xué)系統(tǒng)。2、掃描裝置。3、激光光源。4、檢測系統(tǒng)。整套儀器由計算機(jī)控制，各部件之間的操作切換都可在計算機(jī)操作平臺界面中方便靈活地進(jìn)行。

　　

　　1、顯微鏡光學(xué)系統(tǒng)

　　

　　顯微鏡是顯微鏡的主要組件，它關(guān)系到系統(tǒng)的成象質(zhì)量。顯微鏡光路以無限遠(yuǎn)光學(xué)系統(tǒng)可方便地在其中插人光學(xué)選件而不影響成象質(zhì)量和測量精度。物鏡應(yīng)選取大數(shù)值孔徑平場復(fù)消色差物鏡，有利于熒光的采集和成象的清晰。物鏡組的轉(zhuǎn)換，濾色片組的選取，載物臺的移動調(diào)節(jié)，焦平面的記憶鎖定都應(yīng)由計算機(jī)自動控制。

　　

　　2、掃描裝置

　　

　　激光共聚焦掃描顯微鏡使用的掃描裝置在生物領(lǐng)域一般為鏡掃描。由于轉(zhuǎn)鏡只需偏轉(zhuǎn)很小角度就能涉及很大的掃描范圍，圖象采集速度大大提高，512×512畫面每秒可達(dá)4幀以上，有利于那些壽命短的離子作熒光測定。掃描系統(tǒng)的工作程序由計算機(jī)自動控制。

　　

　　3、激光光源

　　

　　顯微鏡使用的激光光源有單激光和多激光系統(tǒng)。多激光器系統(tǒng)在可見光范圍使用多譜線氬離子激光器，發(fā)射波長為457nm、488nm和514nm的藍(lán)綠光，氦氖綠激光器提供發(fā)射波長為543nm的綠光，氦氖紅激光器發(fā)射波長為633nm的紅光，新的405nm半導(dǎo)體激光器的出現(xiàn)可以提供近紫外譜線，但是小巧便宜而且維護(hù)簡單。

　　

　　4、檢測系統(tǒng)

　　

　　激光共聚焦掃描顯微鏡為多通道熒光采集系統(tǒng)，一般有三個熒光通道和一個透射光通道，能升級到四個熒光通道，可對物體進(jìn)行多譜線激光激發(fā)，樣品發(fā)射熒光的探測器為感光靈敏度高的光電倍增管PMT，配有高速12位A/D轉(zhuǎn)換器，可以做光子計數(shù)。PMT前設(shè)置針孔，由計算機(jī)軟件調(diào)節(jié)針孔大小，光路中設(shè)有能自動切換的濾色片組，滿足不同測量的需要,也有通過光柵或棱鏡分光后進(jìn)行光譜掃描功能的設(shè)置。